《暧暧内含光》是一部带有科幻色彩的爱情影片，同样是一部讨论爱情哲学的剧情片。
说它是爱情片，是因为它是以爱情，婚姻，家庭为主要内容的故事片。说它是科幻片，是因为它是以“修改记忆”这一尚未揭示的科学原理为基本依据，加以想象，在营造的幻想虚拟世界中展现某一戏剧事件的影片。
整部电影带在科幻色彩的包装下，在大的回环式结构下，运用时空混乱、情节破碎的非线性叙事结构将对爱情的探讨层层推进，大致可以分为序幕、开端、发展、高潮、结局、尾声六个部分。
非线性叙事结构，不同于三幕式和五幕式线性叙事结构，它打破和解除了电影的单一时间向度，使时间片段不再完整，甚至产生前后完全颠倒的效果。
而基于现实的因果关系情节、事件情节和动作被非现实的主观心理逻辑取代。
这部电影最为人津津乐道的是其复杂破碎的叙事结构、古典超现实主义的摄影风格和影片色调的一些应用。
序幕——暗示背景：
电影开头的前十七分钟，通过倒叙的方式把故事结尾的一部分放到了影片最开始，描述了张北和林秋再次相遇的过程，男女主角在命运的安排下都乘上了去往滨海的火车，张北对陌生的林秋心有好感，而女主也大方地主动和他搭讪。
开头的序幕实际上暗示了两人曾相识的背景。
接下来时交代背景——故事的开始：
序幕之后，故事一转，从张北自“空白读档公司”咨询回来的那天夜晚，也就是他即将删除记忆之前开始。在这一部分中，主要故事顺序推进，并通过插叙交代已经做完手术的林秋全然不认识张北，张北一怒之下找到“空白读档公司”的过程。
这一部分的结构处理交代了张北同样选择去做记忆清除手术的背景原因，也为后续情节的发展做了铺垫。
紧接着就是故事的发展阶段——主要回溯张北和林秋的交往经历：
在解释张北去咨询记忆清除的原委之后，主要情节仍然顺序推进，开始讲述张北准备手术和手术进行的过程，同时又在清除记忆的过程中回溯两人的交往经历，包括恋爱过程中种种矛盾的产生，这个阶段对爱情的多元刻画层层深入，从而明确两人爱情裂缝产生的原因。
在这个阶段，次要人物关系例如博士李明诚和钟雪、孙海平与钟雪、刘杰和林秋的关系也浮现了出来。
另外，张北这一回忆过程和现实中的手术进程的相互交错又是通过插叙来完成的。所以总结来说，这段顺叙了张北手术过程，插叙了男女主角的恋爱回忆，而这些回忆又是以倒叙为逻辑讲述的。
接下来就是故事的高·潮阶段——双层嵌套：
现实中正在进行手术的张北处于第一层结构中，潜意识记忆中的张北属于第二层结构，因为手术设备技术原因导致的失误将张北从自己的潜意识拉回到现实，即又回到第一层结构。
张北不断地在现实和潜意识的双层结构里相互转换，即现实与回忆两层结构相互插叙，层层相套，一步步渲染张北在回忆自己与林秋的感情后想要中断手术的悔恨之情，并通过回忆的推进将故事推向高潮，也为两人的再次相遇做铺垫。
最后阶段就到了故事的结局——解决矛盾：
张北意识删除前的最后回忆是林秋让他再次回到他们最初相遇的地方——滨海，此处照应开头序幕部分的倒叙，解释为什么张北会无缘无故翘班去滨海。同时也暗示了后面的结局，解释两人再次相遇后的发展和矛盾的解决。
两人在火车相遇之后，又有了浪漫的冰上约会，张北开车送林秋回自己家的路上，林秋意外收到了一封来信，她在车内播放了信封中的录音带，录音带里是林秋在“空白读档公司”里倾吐对于张北的厌恶。
而很快张北也收到了同样的信封，里面的录音带里是他曾经对林秋的恶评。
林秋无法忍受录音带里张北对她的羞辱，转身离开，张北冲出房门追上她。林秋觉得即使重新相爱一次，对方依然会因为她的浑身缺点而觉得乏味和不自由。
但张北耸耸肩说了声“好吧”，似乎他也早就有了这样的预感，但仍然选择执着去爱。
最后冲突得到了解决，整个故事的主题获得升华。
尾声——结尾是这样的，老年的林秋重新回到“空白读档公司”，再一次要求抹去她对张北的记忆，然后镜头会告诉观众，根据记录她已经做过好多次手术了……
（原版电影是改变之后的结尾也就是那段男主和女主在雪地里嬉戏的镜头，这个镜头重复了三次，是一个模棱两可的结局……）
这就是《暧暧内含光》整部电影的大概故事内容和结构形式！
整个剧组依然在拍摄张北卧室内助手三人组的戏份。
此时拍摄的是钟雪来了张北的公寓之后，因为从外面进来感觉寒冷想要找点酒，但卧室里只有孙海平和刘杰之前喝的啤酒。
所以，她说要去履行'女主人'的职责——去厨房其他地方找白酒。
“钟雪不喜欢我，”刘杰皱着眉头抱怨道，“从来没有女人喜欢我。”
“也许，如果你不再偷她们的内裤，会有人喜欢的……”孙海平调侃了一句。
“我还没跟你讲事情的全部，平哥。”刘杰面有愧色地承认了，正要继续往下说结果钟雪拿着找到的白酒和两个小杯子进来了。
“真没想到还真找到了。”钟雪一边倒酒一边问，“哦，刘杰，你不喝的，对吧？”
“我……好吧……”
钟雪不管不顾，只给孙海平和自己每人倒了一杯，递给孙海平一杯，举起自己的那杯酒，说了一句祝酒词：
“‘祝福那些健忘的人吧，因为他们战胜了自己过去的错误。’”
两人很暧昧的开始干杯，孙海平有点受宠若惊。
这个喝酒的镜头前面曾嚟已经NG了四五遍了，主要是喝酒以及吸引孙海平的眼神没有到位，看来这一次很不错，执行导演没有喊停，那就是要继续拍摄接下来的画面了……
“这是尼采在《善恶之彼岸》里说的，你们觉得怎么样？我从《名人名言》中摘录的……”
钟雪说着瞟了一眼床上的张北。
“很好。”孙海平说。
“我一直想有机会读给博士听。”钟雪自顾自的说道，眼眸中闪过几丝迷恋。
曾嚟把这个情绪表演的非常到位，摄影师也给了她一个特写镜头。
看了一眼钟雪的神色，孙海平的脸色变阴郁了：“是句好名言。”
“《善恶之彼岸》是什么？”刘杰很感兴趣地问。
“尼采的一本哲学著作。”孙海平回答。
“哦哦，我听过他，《名人名言》我也读过，有这么一句‘选择你所喜欢的，爱你所选择的。’这一句我很喜欢。”
无知的刘杰假装知道这本书，试图跟上他们谈论的话题———
“很不错。”孙海平道。
“铭记在脑海中的名言能激发出优秀的思想。”钟雪也说了一句。
“好。”刘杰有点被认可的激动，“说得妙。”
“我喜欢读智者说的话。那么多优秀的作品，人类不断在同自我对话，懂吗？”
“唔。”孙海平答道。
“你觉不觉得，博士也是这类人？智者？”
“唔。”还是孙海平。
“当然！”刘杰支持她。
“总有一天，博士说过的话也会名列《名人名言》的。”钟雪宣告道，并给自己继续斟上酒。
“当然。”刘杰奉承道，“博士说话可是地道的《名人名言》。”
“好了，这个镜头过了，下一场准备……”执行导演长舒了一口气。
听到这剧镜头过了之后，场中的三人都放松了下来。林东峻也第一时间到监视器前面回放刚才的画面。
看来钟雪在经过几次NG和林东峻的一番指点后，表现还可以。
“曾嚟，这一条表现不错，接下来要继续保持。”
“嗯，导演，我知道。能不能在帮我讲下接下来的戏？”曾嚟穿着戏中的黑色小西装、西裤，一副都市丽人的打扮，拢了拢头发，迟疑道。
西装底下是青色的针织衫，胸部显得很是饱满、性感。
“对床戏有点介意吗？”林东峻看了她一眼，有点疑惑，曾嚟应该是知道这个角色的戏份的，怎么之前没听她提起过？
“不是，”曾嚟摇了摇头，刚才因为NG已经喝过几杯酒的她脸色有点发红，“之前没拍过吻戏……”
后面这句说的很轻，不过林东峻能听清楚。
“……”
这？？
林东峻有点不知道说什么了，马上就是钟雪和助手孙海平的醉酒后的床戏以及吻戏，这戏怎么讲？
“你大学时应该交过男朋友吧，把何兵想象成你聊的很开心的男友应该可以吧？”林东峻以为她第一次拍吻戏有点介意。
曾嚟面有难色，“我……第一次在镜头前接吻，我有点紧张……”
“……”
“好了，大家先休息十五分钟，之后继续拍摄……”林东峻向室内众人喊了一嗓子，“曾嚟，你来厨房一下吧！”
女演员不知道怎么演了，怎么办？
当然是先歇会，让她调整调整情绪呀！
看到导演带着女演员独自去了厨房，室内留下的众人也没什么大惊小怪的，这肯定是去讲戏了啊，还能有啥事？
“我们聊一聊吧，你说说你对钟雪这个角色的理解，我帮你对对戏……”
厨房里也没有坐的地方，两人只能靠墙站着。
“钟雪从外在看，是一个年轻、性感、文艺的女青年，性格有点大大咧咧、古灵精怪，偶尔有点狡黠，她看不上小屁孩一样的刘杰，对孙海平有点意思，不过处于有一搭没一搭的状态，她暗恋着比自己大很多的博士，因为博士具备成功成年男人的各种优点……”
曾嚟开始述说自己对钟雪这个角色的理解，林东峻不时在旁边补充或者表示肯定……
“……孙海平对你既有暗恋又因为曾看见你和上司有亲密动作，他对你的反应是既吸引又抗拒，在半醉半醒间，你们两的接吻……”
林东峻举了举手，不知道怎么说下去了，主要是找不到合适的词语。
“……嗯？”曾嚟听到林东峻不说了转头看向他，“怎么不说了？”
林东峻撇了撇嘴，说不明白啊……
“……要不咱两先试一下……”曾嚟看到他这个样子就知道怎么回事了，迟疑道。
好吧，这不是应该找何兵练习吗？得，我是导演，看来还是演员信任我呀，林东峻有点自得，而且，长得帅还有这好处，不错。
“那就试试吧……我帮你搭搭戏……”林东峻语气很平静。
接下来两人调整了状态后，随便对了几句台词，就拥抱在了一起，紧接着就在两人嘴唇快要到一起的时候，林东峻眼神中闪过几分挣扎，但是曾嚟似醉非醉间喃喃了两句，头颅又靠近了过来。
两人都进入了角色。
林东峻神色间闪过一丝踌躇，最后还是美色冲昏了脑袋，两人吻在了一起……
一股辛辣味充斥在林东峻的口腔中，然后林东峻直接咳嗽了出来……
“咳咳，不好意思，你嘴里酒味太浓了……”
为了更加真实，拍摄中曾嚟和何兵喝的都是真酒。
“哎呀，”曾嚟的脸色更红了，“我刚好像找到点感觉，被你打乱了……”
“要不，再来一次？”
“……”