吴国金在孔兴燮等人的陪同下，穿过第一进狭长的庭院，迎面便是孔府中路的第二道大门，俗称二门。
孔府的二门建于大明初年，门楣高悬明代诗人、吏部尚书、文渊阁大学士李东阳手书"圣人之门"竖匾，下有阀阅承托，门柱有石鼓夹抱。正门左右各有腋门一座，耳房一间。平时来人只走腋门，正门不开，以示庄严。
可是此时，孔兴燮却快走了几步，招呼左右将正门打开，陪同吴国金从正面进入后面。吴国金见状却依旧面无表情，根本不予理会。
入圣人之门后，迎面是一座小巧玲珑、别具一格的屏门，此门建于弘治十六年，门为木构，四周不与垣墙连属，独立院中，类似遮堂门。
屏门顶覆灰瓦，门楣因悬明世宗亲颁"恩赐重光"匾额，故称"重光门"。门的四根圆柱下有石鼓夹抱，上面承托着彩绘的屋顶，前后各缀有四个倒垂的木雕贴金花蕾，故又称"垂花门"。
这重光门在平时也是不开的，只有每逢孔府大典、皇帝临幸、宣读诏旨和举行重大祭孔礼仪时，才鸣礼炮开启。
此时孔兴燮也许是慌乱了手脚，又要招呼人去打开重光门，却被吴国金拦下，于是众人便绕过重光门，继续向里面走去。
重光门因独立院中，把前院和后院隔绝开来，所以又叫"塞门"。据说这样的塞门一般官司宦人家是无资格建立的，只有封爵的"邦君"才能享受此荣，故《论语·八佾》中有"邦君树塞门"的记载。重光门两面三刀侧的东西厅房，是孔府仿照封建王朝的"六部"而设立的六厅。
为了保持与外界的联系，在内宅门专设两种传事的差役，一种叫差弁，一种叫内传事都有十几人，轮番在门旁耳房内值班，随时向外和向内传话。门的西侧还有一个露出墙外特制的水槽--石流，府内规定挑水夫不得进入内宅，只把水倒入槽内隔墙流入内宅。
众人过了重光门，院中有一片台基，台上原有日晷等物，其后便是宽敞的正厅，这里便是孔府的大堂。
这是历代衍圣公宣读圣旨、接见官员、申饬家法族规、审理重大案件，以及节日、寿辰举行仪式的地文。
府中正堂有厅堂五间，进深三间，灰瓦悬山顶。檐下用一斗二升交麻叶斗拱，麻叶头出锋，座斗斗欹，具有明代风格。大堂中央有一绘流云、八宝暖阁，正中的太师椅上，披铺一张斑瓓虎皮，椅前狭长高大的红漆公案上，摆着文房四宝、印盒、签筒。
大堂正中悬挂着一个"统摄宗姓"匾，要历代衍圣公"统摄宗姓，督率训励，申饬教规，使各凛守礼度，无玷圣门"，规定了衍圣公在孔氏家族中的种种特权。从唐代起，历代朝廷就规定曲阜县令由衍圣公兼任，到了明代以后，规定由衍圣公保举孔氏族人兼任。
在大堂的堂内两旁及后部陈列着正一品爵位的仪仗。如金瓜、朝天镫、曲枪、雀枪、钩连枪、更鼓、云牌、龙旗、凤旗、虎旗、伞、扇等还有一些象征其封爵和特权的红底金字官衔牌，如"袭封衍圣公"、"光禄寺大夫"、"紫禁城骑马"、"奉旨稽查山东全省学务"等，每当衍圣出行时，都有专人执掌，以示威严。
大堂之后有一通廊与二堂相连，两堂呈"工"字形。通廊里有一条大长红漆凳，称"阁老凳"。据传明代权臣严嵩被劾将要治罪时，曾到孔府来托其孙女婿衍圣公向皇帝说情，孔府主人未允。此凳系当年严阁老坐候之物。
在大堂的后面也叫后厅，是衍圣公会见四品以上官僚及受皇帝委托第年替朝廷考试礼学、乐学童生的地方室内正中上、下挂着"钦承圣绪"和"诗书礼乐"的大匾，两旁立着几块石碑。二堂两头的梢间，东为启事厅，西为伴官厅。
说实话，吴国金此时走的已经有些累了，但是见大队人马依然向前面走着。再看身旁的孔兴燮也陪着笑脸向前走着，便不动声色的大步向前，心中却已经将历代衍圣公的奢华生活给骂了个遍。
在二堂之后，有个不大的庭院，在庭院里有两棵冲天挺拔的苍桧并列两旁，还有六个石雕盆内各立一块奇形怪状的太湖石，此院的北屋即是三堂。
孔府的三堂也叫退厅，是衍圣公接见四品以上官员的地方，也是他们处理家族内部纠纷和处罚府内仆役的场所，此院的东西配房各有一进院落，东为册房掌管公府的地亩册契，内为司房掌管公府的总务和财务；西为书房，为当年公府的文书档案室。
此时吴国金等人进入三堂院内之后，便看到了两面的配房和跨院，上面都写有匾额。
于是吴国金笑了笑，立即命随行的部下上前，先将东面的孔府司房、西面的衍圣公书房封锁起来，孔府内的任何人，包括衍圣公孔兴燮都不得再出入这两处。
“将里面的账簿、记录、文卷、书册、图集等，全部就地查封，不能放过任何蛛丝马迹！”
“是！”
此时军情部的随行人马全都身穿飞鱼服样式的统一官服，一个个都是精神抖擞，每个随行人马都是人高马大、器宇轩昂的。
在孔兴燮等孔家人的眼里，这些人马全都是锦衣卫的样貌，随着吴国金的一声令下，这些“锦衣卫”已经开始查封抄家了！
“大人啊！”
孔兴燮被吓得大喊一声，脸色越发的惨白，周围不少人都是面色悲戚。
吴国金见状则是冷笑一声，一把拉住孔兴燮，说道：“衍圣公这是何意？本部堂不过是例行公事罢了。如果此番衍圣公只是忠心为国上书，则一切都没有问题，更不用慌张的。不过……”
吴国金的语气突然阴冷了起来，说道：“不过如果衍圣公真的结党营私，背后还有一党，此番上书也不是出于什么忠心，而是别有用心，恐怕……”
“恐怕传承数百年的衍圣公一脉，到了您这里就要突生变故了！”
听了吴国金的话，孔兴燮被吓得摇晃了几下，差一点就一屁股坐在地上，被左右的族人给搀扶住了。
吴国金见状不置可否，只是说道：“还请衍圣公继续带路，咱们找一个能够说话的地方，如何！”
孔兴燮急忙答应下来，带着吴国金等人继续向前，众人直接进入二堂内落座。
其实在过了三堂之后，便是孔府的内宅部分，亦称内宅院。有道禁门---内宅门与外界相隔。此门戒备森严，任何外人不得擅自入内。有历代皇帝特赐的虎尾棍、燕翅镗、金头玉棍三对兵器，由守门人持武器立于门前，有不遵令擅入者"严惩不贷"。
而在内宅的后面，还有前上房、前堂楼、后堂楼、后花园等建筑，可见孔府规模之大、占地之广。
此时在二堂上，孔兴燮请吴国金坐上座，但是吴国金却说道：“衍圣公乃是文官之首，理应坐在上座。”
说完，吴国金便自顾自的坐在下首首位，孔兴燮见状也只好坐在上首。
其余众人也纷纷坐下。
吴国金看了看在座的众人，问道：“敢问衍圣公，在座的诸位都是什么人？”
孔兴燮说道：“是这样的，这几位都是孔府的管事、宗亲。”
“让他们全都退下吧。”
吴国金冷声说道：“自有人对他们进行讯问，就不用在这里候着了。”
几个孔府的管事、孔家的宗亲见状纷纷看向了孔兴燮，只见孔兴燮叹气摇头，众人只好纷纷退下。
这几人基本上全都是孔兴燮的长辈，虽然孔兴燮承袭了衍圣公的封好，可是在场的几人在孔府内也是说得上话的人物。
此时众人被吴国金直接“赶出去”，颜面上也有些挂不住，便有一人站出来说道：“吴部堂虽然是内阁重臣、军情部尚书，但是在孔府内，也要放尊重些！”
另一人接着说道：“我孔家到底犯了什么国法，还请吴部堂说清楚，否则他日衍圣公向朝廷伸冤，部堂这边也不好收尾！”
吴国金冷笑着问道：“这两位是……？”
孔兴燮急忙对那两人使眼色，让二人立即退下去，同时说道：“部堂勿怪，这位是我孔府的主事孔明德，旁边那位是我孔家的长辈，虽然是远房，但也是我的叔父辈：孔曲明。”
吴国金冷笑着点了点头，并没有回答他二人的话，只是对左右说道：“对孔府上下的质询和调查，就先从这二人开始，带下去！”
“是！”
随后几名军情部的人马大步上前，当着衍圣公孔兴燮的面，将孔明德和孔曲明当场拿下，押解着走出了堂上，看得孔兴燮目瞪口呆，浑身止不住的颤抖着。
这一幕发生后，其余孔府中人纷纷退下，再没有人敢对吴国金说什么，就连孔兴燮也闭上了嘴，紧张的坐在椅子上低头不语。
俗话说：秀才遇到兵，有理说不清，更何况是遇到了锦衣卫的延续，当今的军情部尚书？
待到“闲杂人等”全部出去之后，吴国金对左右部下说道：“对孔府上下的审查立即开始，不管是孔府的管事官吏、宗亲人等，还是后宅的女眷，只要是十岁以上的，全都要录下一份口供，并且要对所有人的口供进行核对，防止胡说与串供。”
“另外，让祖参将带些人马进来，将孔府内外给我搜查一遍，任何可以的东西，不管是什么，全都立即查封起来，等候本部堂处置！”
“是！”
听说吴国金还要对内宅的女眷进行审问，孔兴燮顿时涨红了脸，这已经不仅仅是安危的事情了，更关系到衍圣公孔府上下的颜面。
如果今日之事传出去，那衍圣公的颜面就真的要沦为天下笑柄了！
于是孔兴燮猛地站了起来，说道：“部堂大人！就算是军情部锦衣卫，也要讲究证据，你们如此大张旗鼓的来到我孔府，总要有个说法，要拿出证据来，怎可如此粗鲁的骚扰孔家的内眷！”
吴国金冷笑着说道：“说法？之前你趁着朝廷大军出征在外，趁着阁老在军中作战，几次上书朝廷，你知道有多少文官追风上书吗？你知道在朝中引起了多大的风波，给朝廷的大政方针带来了多少阻力？还跟本部堂要证据，你上书的奏章就是证据！”
“如今衍圣公也应该庆幸，阁老率军连战连捷，不但顺利打下了整个西域，朝廷也没有出现太大的动荡。否则前线战事真的不利，这一切的罪责都要由衍圣公来承担。”
吴国金冷声问道：“衍圣公自认为，这么大的罪责，你承担的了吗？”
孔兴燮闻言哑口无言。